انطلاقاً من رؤيتها المتمثلة في التميز بالقدرة على حل المنازعات الزكوية والضريبية والجمركية بكفاءة وتبني أساليب مبتكرة وفعالة, حصلت الأمانة العامة للجان الزكوية والضريبية والجمركية على شهادتين عالمية نظير جهودها المستمرة في رفع جودة الإجراءات والخدمات المقدمة من خلال التزامها بمعايير التميز المؤسسي وفقاً للمواصفات العالمية المتعارف عليها. حيث تمكنت الأمانة العامة من حصولها على اعتماد الايزو في إدارة الجودة (9001ISO )، و اعتماد الايزو في رضا العملاء (10002ISO ) وذلك بعد انتهاء الجهة المانحة من أعمال المراجعة والتأكد على امتثال الأمانة العامة لكامل الإجراءات المتبعة في تطبيق أعلى المعايير والمواصفات العالمية.
وتعتزم الأمانة العامة على مواصلة رحلة التطوير من خلال المبادرات والمشاريع النوعية التي ترفع مستوى التميز المؤسسي والجودة في أعمالها.
