جهات التنفيذ للقرارات الصادرة من اللجان تختلف بحسب اختلاف طبيعة الدعوى فعلى سبيل المثال: في حال كانت الدعوى متعلقة بجباية الزكاة أو تحصيل الضرائب أو الرسوم الجمركية فتكون محكمة التنفيذ العامة أو الإدارية هي الجهة المختصة، فيما لو كانت الدعوى جزائية (متعلقة بقضايا التهريب الجمركي) فتكون أمارة المنطقة المعنية بالاختصاص المكاني هي جهة التنفيذ.
